iPhoneXの操作で大きく変わった点は、ホームボタン廃止によるロック解除方法ではないでしょうか。
「Face ID」を登録していれば、iPhoneを顔に向けて画面を見るだけでロックが解除できますが、その後ホーム画面を開くには下から上にスワイプしないといけません。
そのままホーム画面を表示してくれれば便利と思うのは私だけでしょうか

この操作は最初全くわからず、ホーム画面に戻れずに困っていました。

他にもアプリを開いている状態で画面下部を右にスワイプすることで直前に開いてアプリに移動できます。

長押しをして「－」を表示させないといけない点が少し面倒になりました。

手が小さい人は画面上部が片手では届かないので、画面を下げる簡易アクセスですが、iPhoneXでは画面下部の端っこをスワイプしないといけません。
これを片手で操作すると落としそうになるので使い難くなったかもしれません。

起動した後、支払い前に指紋認証でよかったのが、顔認証になったので少し面倒になったかもしれません。

バッテリー容量が増えたため以前よりバッテリー残量が気にならなくなりましたが、パッと確認できないのは少し不便です。

個人的にはこれが一番苦戦しました。
画面のサイドボタンのすぐそばに「ダブルクリックでインストール」や「ダブルクリックで支払い」と表示が出ます。
画面のその文字をタップし続けていると、キャンセルになり、またやり直しを何度も何度も行いました。
画面ではなくサイドボタンを2回押してください。